自宅を妻と持分を1/2ずつで購入しています。
この場合、住宅ローン控除はどのようになるのでしょうか？

ご自宅の持分がそれぞれ1/2ずつとのことなので、

例えば3000万円の借入であればご主人と奥様でそれぞれ1500万円が住宅ローン控除の対象となる不動産の取得価格となります。

ただし、ご夫婦それぞれが住宅ローン控除を利用するにはペアローンか連帯債務でのローンを組む必要があります。