比較的割安な旧法借地の中古戸建が見つかったため、
購入してしばらく住み、数年後に非木造の住宅に建て替えしようと思っていますが大丈夫でしょうか？

借地権上の建物の建て替えについては「建替え承諾」を得て「建替え承諾料」を支払うことで可能で、承諾料の相場としては更地価格の３～４％、または借地権価格の５％程度が一般的です。ただし、ご質問者様の場合は木造から非木造へ建て替えを検討されているようなので「借地条件の変更（「非堅固な建物」→「堅固な建物」）」についても承諾を得る必要があると思われます。

なお、これらの承諾を得ないで建て替えをした場合、契約解除となる可能性があります。借地権物件の場合には建て替え、増改築ともに「地主の承諾」を常に念頭に置いておくようにしてください。