自宅マンションの売却が決まりそうなのですが、いざ権利証を探してみてもどこにもありません。権利証を紛失してしまった場合、売却は出来ないのでしょうか？

権利証が無くても所有者本人であれば所有権移転登記はできますのでご安心下さい。ただ、再発行などはされません。権利証がない分、余分な手続や費用が必要になります。

一般的には本人確認制度を使うのですが、資格者による本人確認と公証人による本人確認があります。資格者は司法書士で大丈夫ですが数万円～十数万円の費用がかかります。もし時間に余裕があるのであれば、公証役場で本人確認をしてもらうと費用を節約できます。