購入する物件に消費税がかかるのは理解できますが、仲介手数料になぜ消費税がかかるのでしょうか？

消費税の課税対象は消費税法という法律で定められており、仲介手数料については仲介業者が宅建業法に基づいて行う仲介業務という役務の対価として「事業者が事業として対価を得て行なう資産の譲渡・貸付・役務の提供」にあたります。