ふるさと納税をしているのですが住宅ローン控除と併用できるのでしょうか？

結論から言うと住宅ローン控除とふるさと納税は併用が可能です。

しかし、住宅ローン控除によって、住民税が控除適用限度額に達している場合は、ふるさと納税の恩恵が受けられなくなります。

これは、まず住宅ローン控除をしたあとに他の控除がなされるためで、損をしないためには事前に所得税や住民税を計算し控除限度を把握しておくと良いでしょう。